Dotée de la prestigieuse université coranique de Sankoré et d’autres medersa, Tombouctou était aux 15ème et 16ème siècles une capitale intellectuelle et spirituelle et un centre de propagation de l’islam en Afrique. Ses trois grandes mosquées (Djingareyber, Sankoré et Sidi Yahia) témoignent de son âge d’or. Bien que restaurés au 16ème siècle, ces monuments sont aujourd’hui menacés par l’avancée du sable.
Depuis 1988, la ville de Tombouctou est classée au patrimoine mondial de l’UNESCO.